Stage à l’OFB. Service connaissance de la Direction régionale Bretagne.
Ce stage a pour objet l’analyse de la dynamique des populations de poissons d’eau douce de Bretagne.
L’objectif du stage est l’évaluation, pour chaque espèce à l’échelle du site et de la région, d’indicateurs de tendance démographique. Il s’inscrit dans la perspective de la révision de la liste rouge régionale (Vigneron et al. 2017) et dans la poursuite des travaux à l’échelle nationale menés par l’OFB (Dortel et al. 2022, Poulet et al. 2011). Les spécificités de la région par rapport aux travaux nationaux sont (i) des séries chronologiques plus longues, (ii) des cortèges faunistiques moins riches et (iii) un réseau hydrographique constitué d’une multitude de petits fleuves côtiers, donc des échanges de faune d’eau douce très rares.
Contenu du stage :
• Affiner le périmètre de l’étude : choix des sites et de la période temporelle sur la base des données de l’ « Application de Saisie Piscicole et Environnementale » (Aspe ; Irz et al. 2022).
• Calcul d’indicateurs simples de dynamique (taux d’occurrence, densité moyenne, succès de reproduction).
• Calage de modèles à partir des outils développés par Dortel et al. (2022).
• Analyser les résultats au regard de l’auto-écologie des espèces et de leur statut de menace aux échelles spatiales régionale, nationale et continentale (Freyhof & Brooks 2011 ; IUCN France 2018 ; IUCN France et al. 2019), ainsi que des caractéristiques environnementales des sites prospectés.
L’OFB dispose à cet effet de plusieurs jeux de données :
• Des échantillonnages pluri-annuels de l’ichtyofaune sur un réseau de stations en rivière.
• Le réseau hydrographique et la délimitation des bassins versants.
• Des variables environnementales (dont anthropisation) sur les bassins et les stations.
L’ensemble des analyses et documents produits durant le stage respectera les principes de reproductibilité et d’ouverture du code comme des données (Wilkinson et al. 2016).
Connaissances :
– Statistiques et modélisation
– Ecologie aquatique
– Utilisation du logiciel R
– Dynamique de population
– Utilisation de forge logicielle (ex : Github)
Savoir-être professionnel :
– Curiosité, ouverture d’esprit
– Sens de l’initiative
– Créativité
– Rigueur et organisation
Diplômes – Formation – Expérience :
Niveau bac +5 / Master / Ingénieur / Césure
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