Offre de stage M2

CINEMATIQUE DE NAGE ET PERFORMANCES ATHLETIQUES CHEZ LES SERPENTS : VARIATIONS INTRA ET INTERSPECIFIQUES

Durée et type de contrat : Stage
Niveau d’études : Master 2
Thématique : Ecologie
Date de début du contrat : Janvier-Février 2021
Durée du stage : 6 mois
DESCRIPTION DE L’OFFRE

Contexte
Les transitions-retour vers la vie aquatique ont façonné de nombreux organismes et fortement impacté les écosystèmes marins fossiles et actuels. Etudier les processus évolutifs impliqués reste cependant difficile, des étapes-clés étant manquantes dans la plupart des lignées actuelles. Ce n’est pas le cas des serpents. Tous les intermédiaires existent et un seul mode de déplacement par ondulations est efficace sur terre et dans l’eau. L’hypothèse centrale de ce projet est que l’adaptation à la vie aquatique a modifié la cinétique des ondulations pour optimiser la nage en minimisant les forces de résistance tout en maximisant celles de propulsion. L’efficacité énergétique de la nage devrait donc être plus grande chez les espèces aquatiques. Quantifier cette efficacité, tout en mesurant les performances de nage et la cinématique ondulatoire des individus, est techniquement difficile. L’option choisie ici est de mesurer le coefficient de trainée de l’animal qui nage. Ceci fait appel à des domaines tels que la mécanique des fluides, la modélisation numérique, ou la robotique ; il repose sur un réseau de collaborateurs. La conception de robots serpents capables de progresser sur différents substrats est d’ailleurs un enjeu appliqué du projet. Ce stage s’inscrit dans le projet DRAGON2, financé par l’ANR.

Pour mener à bien ce projet, la constitution d’un répertoire de cinématiques de nage d’une grande diversité d’espèces de serpents est nécessaire. L’objectif du stage est donc d’enregistrer en laboratoire des séquences de nage et de reptation de nombreux individus et de différentes espèces. Qu’ils soient terrestres, semi-aquatiques ou aquatiques, presque tous les serpents sont capables de nager. L’analyse des vidéos, à l’aide de procédures automatiques, permettra de confronter les performances athlétiques enregistrées à la cinématique de nage et ainsi de mieux comprendre comment l’adaptation à la vie aquatique a influencé la nage ondulatoire, notamment en optimisant la fréquence et/ou l’amplitude des oscillations. Plusieurs facteurs seront pris en compte, comme l’âge, le sexe, la taille, le mode de chasse, le statut reproducteur et la condition corporelle, permettant ainsi de mettre en évidence les variations intra et interspécifiques au sein de la phylogénie des serpents.

Description du poste
L’étudiant(e) sera basé au Centre d’Etudes Biologiques de Chizé (CEBC). Il, elle, aura pour mission la collecte et le traitement des vidéos de nage des serpents. En début de stage il sera nécessaire de se familiariser avec la programmation Python et de participer à l’amélioration des scripts permettant l’extraction des données des vidéos. Lors de la période d’activité des serpents, il participera au programme de Capture-Marquage-Recapture dans la Réserve Biologique Intégrale de la forêt de Chizé et aux expérimentations en banc de nage des individus capturés et sélectionnés pour l’étude. Il extraira et analysera ensuite les données récoltées.

Modalités
Le stagiaire pourra être hébergé au CEBC. Le travail sera encadré par Guillaume FOSSERIES, doctorant au CEBC, et par Xavier Bonnet (DR CNRS) impliqués dans le projet Dragon2.

PROFIL CANDIDAT/E

Etudiant(e) en Master 2 Ecologie, évolution, écophysiologie. Etant donné la nature du projet, d’autres filières, qui incluent des compétences en physique ou mécanique par exemple, sont compatibles.

Compétences :
Esprit de synthèse, intérêt pour la recherche en écologie évolutive. Qualités rédactionnelles, esprit d’initiative, goût pour le terrain. Des compétences en programmation Python ou Matlab seront appréciées. Une expérience avec les serpents sera prise en compte.

CONDITIONS DE TRAVAIL

Lieu du stage
UMR 7372 CNRS – Centre d’Etudes Biologiques de Chizé
Bâtiment H Ouest

Conditions de travail selon cadre définit dans la convention de stage Université/CNRS. Gratification CNRS.

Candidature
Adresser un CV et une lettre de motivation avant fin novembre par mail à [email protected] et [email protected]

Le contenu de cette offre est la responsabilité de ses auteurs. Pour toute question relative à cette offre en particulier (date, lieu, mode de candidature, etc.), merci de les contacter directement.

Pout toute autre question, vous pouvez contacter [email protected].