Depuis 2012, le bureau d’étude TerrOïko utilise un outil de simulation de la biodiversité “MetaConnect” qu’il a developpé en collaboration avec la Station d’écologie expérimentale du CNRS à Moulis (SEEM CNRS, USR 2936 http://www.ecoex-moulis.cnrs.fr/). Actuellement, MetaConnect est un modèle extrêmement flexible permettant la réalisation d’étude de viabilité des méta-populations. MetaConnect est un modèle individu centré basé sur les processus biologiques sous-jacents à la dynamique écologique de l’espèce et spatialement explicite. Cette base, permet déjà de réaliser nombres d’études aussi bien théoriques qu’appliquées. Cependant, son utilisation est pour le moment restreinte aux espèces terrestres ou partiellements terrestres (amphibiens, odonates…).

L’objectif du stage proposé ici est d’étendre le champ d’action de MetaConnect aux espèces strictements aquatiques (poissons).

Le stagiaire participera à :
l’identification des paramètres devant être pris en compte pour simuler la vie des espèces aquatiques (recherche bibliographique)
l’implémentation d’un nouveau module à MetaConnect (R, Matlab, C++), sachant que le travail a déjà été commencé chez TerrOïko et que le stagiaire sera aidé/formé par TerrOïko
la validation du nouveau module en comparant les résultats obtenues par les simulations avec des jeux de données déjà disponible de concernant plusieurs espèces de poissons sur les bassins versants de l’Adour et de la Garonne

Responsable du stage :
Sylvain Moulherat (https://www.researchgate.net/profile/Sylvain_Moulherat)
Simon Blanchet (http://simonblanchet.weebly.com/)
Ils seront assistés par Matthieu Moulherat (http://www.terroiko.fr/CVs/cvmatthieu.php) pour l’intégration des modèles dans la plateforme MetaConnect

Lieu du stage :
Le stage peut se dérouler dans les trois lieux suivants :
Bureau de TerrOïko à Revel
Laboratoire Évolution et diversité biologique à Toulouse (suivant disponibilité)
Station d’Écologie Expérimentale du CNRS à Moulis (SEEM, USR 2936)

Compétences requises :
Bonne maîtrise de R
Motivation à travailler à l’interface entre modélisation et écologie et entre recherche théorique et application concrête en bureau d’étude

Le contenu de cette offre est la responsabilité de ses auteurs. Pour toute question relative à cette offre en particulier (date, lieu, mode de candidature, etc.), merci de les contacter directement.

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