Résumé du projet/Summary
Ce projet de thèse propose une approche multi-omique innovante en écotoxicologie, qui consiste en l’obtention des profils transcriptomiques et lipidomiques chez l’espèce sentinelle Gammarus fossarum et leurs analyses intégrées. Cette démarche permettra de comprendre la plasticité moléculaire du métabolisme énergétique, identifiant les gènes et les lipides clés impliqués dans les changements physiologiques liés à la reproduction et la modulation de leur abondance en réponse à la contamination.

This PhD project proposes an innovative multi –omics approach in ecotoxicology, consisting in obtaining and integrating transcriptomics and lipidomics profiles in the sentinel species Gammarus fossarum. This approach will allow understanding the molecular plasticity of energy metabolism, identifying the key genes and lipids associated with normal and pathological reproduction.

Profil du candidat/Candidate profile :
Bioinformaticien(ne) ou biochimiste avec une expérience certifiée (e.g. stage Master 2) en analyses bioinformatique (e.g. RNA-seq) et statistique. Bonne connaissance de l’environnement R et du language Python. Un intérêt à l’application des approches -omiques dans un contexte écotoxicologique sera un atout.

Bioinformatician or biochemist with proved experience in bioinformatics (e.g. Master level, experience in RNA-seq analysis) and statistics. Good knowledge of R and programming language Python. Interest in applying –omics approaches in environmental contexts will be an asset.

Davide Degli Esposti
Chargé de Recherche/Research Scientist
Irstea – Laboratoire d’écotoxicologie
UR RiverLy
[email protected]

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