Volontaire Service Civique 6 mois en Eco-épidémiologie / Oiseaux marins – Terres Australes

ECOLOGUE Programme 1151 – île d’Amsterdam

Dans le cadre du Volontariat de Service Civique, l’Institut Polaire Français recherche un biologiste (H/F) pour travailler sur l’Ile d’Amsterdam, dans les Terre Australes et Antarctiques. Le candidat participera à une campagne d’une durée d’environ 6 mois (environ Octobre 2017 à Mars 2018) pour un programme développé par une équipe de recherche du CEFE (CNRS-Université Montpellier) en collaboration avec d’autres laboratoires sur l’écologie de la circulation des agents infectieux dans les populations de vertébrés coloniaux (voir résumé ci-dessous).

Libellé du poste : Ecologue et/ou vétérinaire – 1 poste
Objectifs du programme :
– Assurer la continuité et poursuite de suivis éco-épidémiologique sur les populations de vertébrés coloniaux (oiseaux et pinnipèdes), au moyen de l’utilisation du marquage des individus (baguage, pose de marques), de la prise d’échantillons (prises de sang, écouvillonnage), de recaptures et de suivis sur le terrain.
– Participer à la conduite de programmes de recherche spécifiques sur l’écologie de la circulation d’agents infectieux et la réponse des populations de vertébrés coloniaux à la variabilité de l’environnement en contribuant à l’étude des mouvement des individus et de moyens potentiels d’intervention pour protéger les populations des effets d’agents pathogènes.

Tâches à effectuer :
– Dans le cadre des suivis éco-épidémiologiques intra- et inter-annuels, le travail consistera à collecter des données et des échantillons sur le terrain (lectures de bagues, prises de sang, réalisation d’écouvillons cloacaux, prises de mensurations, baguage, suivis de reproduction) et à intégrer ces données dans une base de données existante, en coordination avec un autre programme.
– Dans le cadre des programmes de recherche spécifiques, le travail consistera à contribuer à des études sur la reproduction et le comportement des espèces d’espèces d’oiseaux marins en relation avec leur exposition à des agents infectieux en réalisant des observations directes, des collectes d’échantillons (prises de sang, écouvillons), et l’acquisition de données sur les activités et mouvements des oiseaux via le déploiement d’appareils enregistreurs miniaturisés.

Formation : Biologiste/écologue/vétérinaire
– Avoir de bonnes connaissances naturalistes (ornithologie, mammalogie) et avoir, si possible, déjà manipulé (baguage, mensurations, prise de sang) des oiseaux et des mammifères dans le cadre de programme de suivis de la faune sauvage.
– Maîtriser les outils informatiques de base (tableur, gestion de bases de données) et éventuellement les SIG.
– Un plus est d’avoir participé à des programmes de recherche sur les oiseaux ou sur les mammifères, par exemple d’avoir contribué à des suivi d’individus marqués, d’avoir une expérience dans l’utilisation d’appareils électroniques de type GPS miniature et/ou dans la réalisation de prélèvements pour analyses biologiques.

Conditions particulières :
– Ne pas craindre de travailler pendant des heures à l’extérieur dans des conditions climatiques souvent difficiles (vent, pluie, neige…) et en situation isolée.
– Avoir une bonne expérience de la randonnée (marches longues et difficiles, passages en via ferrata).

Lieu : île d’Amsterdam
Départ : prévu en Octobre 2017
Durée : Environ 6 mois
Indemnité mensuelle terrain: environ 1000 euros net non imposable, logé(e) et nourri(e)

Dans un premier temps, MERCI DE CONTACTER Thierry BOULINIER, responsable du programme, en envoyant CV et courrier de motivation.
Email: [email protected] Webpage: https://thierryboulinier.wordpress.com/
Toutes les demandes seront examinées avant le 15 Avril et une réponse sera donnée aux personnes susceptibles d’être retenues.
Pour plus d’informations sur les recrutements de VSC par l’IPEV: http://vsc.ipev.fr/
Titre du programme IPEV ECOPATH (n°1151): Ecologie de la circulation d’agents infectieux dans les populations de vertébrés coloniaux des terres australes et antarctiques: surveillance, compréhension et implications pour la gestion.

Résumé du programme:
La description et la compréhension des facteurs qui affectent la circulation d’agents infectieux dans les populations animales sont importantes d’un point de vue fondamental, mais aussi appliqué. Les populations de vertébrés sauvages vivant dans les zones polaires de l’hémisphère sud sont de plus en plus sujettes à des menaces dues à des maladies infectieuses, en plus d’autres menaces environnementales, et il est primordial de disposer de données de base sur l’état éco-épidémiologique de ces systèmes et de comprendre leurs dynamiques. Les populations de vertébrés se reproduisant en colonies sont particulièrement importantes à étudier dans ce contexte car elles peuvent subir des épisodes de mortalités pouvant atteindre des centaines voire des milliers d’individus, et elles sont distribuées en unités discrètes au sein et entre lesquelles la transmission d’agents infectieux peut être affectée par différents processus complexes. Dans ce projet, nous nous proposons d’explorer comment les processus de dispersion à grande échelle et les interactions locales entre hôtes et parasites peuvent affecter la circulation d’agents infectieux et ses conséquences possibles. Afin de faire cela, nous combinerons des analyses de laboratoire sur des échantillons prélevés sur le terrain dans le cadre de suivi à long-terme et/ou dans un contexte spatialisé, la conduite d’expérimentations de terrain et le développement de modèles. Des techniques de biologie moléculaires modernes et des loggers GPS seront notamment utilisés. Pour l’acquisition de données et d’échantillons, le programme reposera en partie sur les programmes IPEV déjà en place dans des sites clefs. Le travail sera conduit en coordination avec la Réserve Naturelle des Terres Australes et Antarctiques. Un axe spécifique sera développé sur les tiques et agents infectieux transmis par les tiques; un autre axe concernera les agents infectieux transmis d’une façon directe entre individus et potentiellement responsables d’épidémies, tel que l’agent du Cholera aviaire. Enfin, un axe se focalisera sur l’optimisation de la mise en place de programme de surveillance et de gestion.

Résumé du programme pour la saison 2017-2018 :

Au cours de cette saison de ce programme d’éco-épidémiologie, les travaux prévus consisteront en (1) la réalisation d’échantillons (sangs, écouvillons) et du suivi d’individus marqués d’Albatros à bec jaune sur la colonie d’Entrecasteaux (île d’Amsterdam), pour étudier les dynamiques épidémiologiques et les effets de la vaccination d’individus contre l’agent du Choléra aviaire, (2) le suivi des mouvements d’oiseaux susceptibles de disperser un agent infectieux entre sous-colonies, et (3) la coordination et la réalisation de collectes d’échantillons de tiques et de sang permettant notamment des analyses sur l’écologie et l’évolution des tiques et des agents infectieux qu’elles transmettent (îles d’Amsterdam et autres sites des TAAF). Ces travaux de terrain seront menés en parallèle du développement d’une approche intégrée de ces questions et de leurs implications pour la gestion.

Références de l’équipe:

Chambert, T., Staszewski, V., Lobato, E., Choquet, R., McCoy, K.D., Tveraa, T. & Boulinier T. 2012. Exposure of Black-legged kittiwakes to Lyme disease spirochetes: dynamics of the immune status of adult individuals and effects on their survival. Journal of Animal Ecology 81: 986-995.

Dietrich, M., Kempf, F., Boulinier, T. & McCoy, K.D. 2014. Tracing the colonisation and diversification of the worldwide seabird ectoparasite Ixodes uriae. Molecular Ecology 23: 3292-3305.

Garnier, R., Ramos, R., Staszewski, V., Militão, T., Lobato, E., González-Solís, J. & Boulinier, T. 2012. Maternal antibody persistence: a neglected life history trait with implications from albatross conservation to comparative immunology. Proceedings of the Royal Society, London B 279: 2033-2041.

Ponchon, A., Grémillet, D., Doligez, B., Chambert, T., Tveraa, T., González-Solís, J. & Boulinier, T. 2013. Tracking prospecting movements involved in breeding habitat selection: insights, pitfalls and perspectives. Methods in Ecology and Evolution 4: 143-150.

Ramos, R., Garnier, R., Gonzalez-Solis, J. & Boulinier, T. 2014. Long antibody persistence and transgenerational transfer of immunity in a long-lived vertebrate. The American Naturalist 184: 764-776.

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